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Aplicación de secuenciación ChIP

Chip

La inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) estudia las interacciones entre el ADN y las proteínas, proporcionando una reflexión más auténtica y completa de las proteínas reguladoras unidas a las secuencias de ADN. Después de la reticulación de las muestras, los fragmentos de ADN con longitudes concentradas entre 100 y 750 pb se obtienen mediante el cizallamiento de la cromatina, que se puede utilizar para la secuenciación de próxima generación para obtener información de las interacciones entre el ADN y las proteínas.

BoFU-80 concentra la energía acústica en la muestra que se va a procesar a través de un sistema de ultrasonido focalizado de alta frecuencia de manera eficiente. BoFU-80 podría lograr un daño proteico eficiente, altamente repetitivo y bajo en el cizallamiento de la cromatina. Después de la reticulación y el cizallamiento de muestras de bacterias o células, utilizando ealctroporesis en gel de agarosa para detectar. Los números de muestra para cada carril etiquetado como Marcador, muestra 1, muestra fragmentada 1, muestra 2, muestra fragmentada 2, muestra 3, muestra fragmentada 3, muestra 4, muestra fragmentada 4 secuencialmente . Se puede ver que la integridad del ADN es excelente desde los carriles 1, 3, 5 y 7. Y en los carriles 2, 4, 6 y 8, se puede ver que después del cizallamiento de la cromatina, la longitud de los fragmentos de ADN se concentra entre 100 y 750 pb, y existe una alta repetibilidad entre las muestras.