Microbiología

BoFU-80: Identificación MALDI-TOF asistida por ultrasonido de Rhizopus oryzae

Rhizopus oryzae Es común que exista en el suelo, el aire y otras sustancias. Es un moho importante en la fermentación de los alimentos porque puede causar la descomposición de los alimentos. Su colonia es suelta o densa, que inicialmente es blanca y luego se vuelve de color marrón grisáceo a marrón negro. Las raíces falsas están bien desarrolladas, con ramificaciones en forma de dedo o raíz, y son hongos filamentosos típicos que son difíciles de atravesar. La proteína se extrajo mediante el método estándar de extracción de ácido fórmico recomendado por Bruker e identificado con MALDI-TOF, pero no se encontró ningún pico marcador obvio y no se pudo detectar. Después de usar un kit de reactivos para la ruptura y extracción de la pared celular, se identificaron tres picos característicos, pero había mucho ruido y la relación de masa (m/z) del pico era inferior a 200.

El BoFU-80 utiliza un sistema de ultrasonido focalizado de alta frecuencia para concentrar la energía acústica en la muestra a procesar, lo que puede mejorar la tasa de extracción de proteínas de la cepa de manera efectiva y mejorar la tasa de detección del sistema MALDI-TOF. Utilizando ultrasonido focalizado y kit de reactivos para extraer la proteína para la detección de MALDI-TOF, se obtuvieron seis picos marcadores, con una relación pico-masa (m/z) superior a 400 y una puntuación de 9,169 que indica un alto nivel de confianza.