Ultrasonicadores enfocados de medio rendimiento: ¿Cuándo tienen más sentido 8 posiciones de muestra?

En muchos laboratorios existe una zona intermedia engorrosa.

Tardan demasiado si tomas una muestra a la vez. Dieciséis o más puestos suena bien, pero quizá rara vez haya dieciséis muestras disponibles bajo las mismas condiciones en el laboratorio.

¡Ahí es donde los ultrasonicadores enfocados que funcionan a medio rendimiento se vuelven interesantes!

En esta discusión, "rendimiento medio" no es simplemente un número impreso en una hoja de especificaciones. Se aplica a laboratorios donde normalmente se procesan varias muestras a la vez, pero que requieren flexibilidad para tratar lotes incompletos, tipos de muestras variables o condiciones acústicas variables.

El Ultrasonicador Focalizado BoFU-800 de Longlight permite el procesamiento de 1 a 8 muestras simultáneamente con 8 posiciones de muestra, ya sea como condiciones individuales de muestra o procesamiento por lotes. Ese puede ser un buen ejemplo a considerar al debatir la cuestión operativa, no solo la tecnología.

El rendimiento medio es realmente un problema de planificación: hay dos enfoques para la planificación. Hay dos enfoques para la planificación.

Al considerar el número de pozos que tiene un instrumento, primero piensa en lo que normalmente acaba en el banco.

¿Cuántas muestras reciben un martes típico?

No es el proyecto más extenso de este año. No es el número que el laboratorio querría procesar tras la expansión. La cola normal es más útil.

Por la mañana, un grupo de genómica puede obtener 4 muestras de ADN; Después de comer, 3 muestras de cromatina; Después de comer, 2 muestras de FFPE con un protocolo diferente. Ese día, el laboratorio tenía en realidad nueve muestras, pero no un lote de nueve muestras.

Eso marca la diferencia en la elección del equipo.

En algunas plataformas, los pocos puestos extra que tienen pueden usarse para trabajos menos útiles durante el día porque los investigadores no esperan a tener un rack completo para empezar.

En una carrera, una posición vacía no debería detenerla.

Una característica útil de una plataforma de rendimiento medio es que puede usarse para realizar lotes parciales sin crear problemas de flujo de trabajo por posiciones no utilizadas.

El modo de procesamiento gratuito de muestras en BoFU-800 permite el procesamiento de 1 a 8 muestras con las condiciones personalizadas para cada muestra individual. Sin embargo, no es en modo en tiempo real, sino en lote, lo cual es adecuado para muestras que realmente requieren el mismo proceso.

Lo que puede parecer una diferencia pequeña no importa tanto como parece.

El laboratorio debería poder realizar seis muestras si hay seis muestras listas. Si 4 son de un protocolo y 2 de otro protocolo diferente, surge la pregunta de si el instrumento puede acomodar trabajo real o si el trabajo puede acomodar el instrumento.

La ultrasonicación enfocada forma parte de Longlight Cizallamiento de ADN/ARN portafolio de herramientas para la fragmentación de ácidos nucleicos y la preparación de muestras NGS. La flexibilidad con las muestras entrantes puede ser tan importante como el número de canales en ese entorno.

Hay dos modos diferentes: Modo Libre y Modo por lotes

El término "procesamiento por lotes" implica naturalmente que es más eficiente.

A veces sí.

Para ocho muestras de ADN similares, solo es necesario introducir un conjunto de condiciones y puede procesarse en lote, minimizando la repetición de la configuración.

Sin embargo, el trabajo de investigación mixto no es así.

Muestras de proyectos no relacionados pueden entregarse a una instalación central. Un laboratorio NGS podría trabajar con la fragmentación del ADN, mientras que otro proyecto requiere cizallamiento de cromatina. En una situación así, tiene poco sentido tener varias posiciones, ya que todo se ve forzado a un método común.

Por tanto, la comparación relevante no es manual frente a lote.

Es:

¿Cuándo tiene sentido usar un protocolo compartido? ¿Cuándo tiene sentido tener un protocolo independiente?

Cuando el sistema puede hacer ambas cosas sin complicar innecesariamente ninguno de los procesos, es un sistema de rendimiento medio.

¡Necesitas ocho muestras, eso son ocho discos!

Otro problema con el rendimiento es retener el conocimiento de lo que ocurrió con cada muestra.

Un tubo puede ocasionalmente hacer que un operador recuerde y reescriba la secuencia desde un cuaderno.

Pero con varias muestras, no es tan fácil.

La reproducibilidad incluye la identidad de la muestra, condiciones seleccionadas, historial de ejecuciones y cambios de método. Según Longlight, la información de procesamiento del BoFU-800 se puede recuperar tras la ejecución, lo que ayudará a registrar el procesamiento de muestras. El sistema también incluye un sistema operativo incorporado y no necesita un ordenador externo.

Esto es especialmente cierto en el caso de los laboratorios compartidos. El operador de un método seis meses después del desarrollo puede no ser la misma persona.

La dependencia de la memoria debería minimizarse aumentando el volumen de muestras para un flujo de trabajo de rendimiento medio.

El sistema de control de temperatura debe ser capaz de funcionar durante todo el lote.

La adición de posiciones no debe ir seguida de la incorporación de condiciones de muestra no controladas.

La introducción de energía acústica en el entorno de la muestra mediante el procesamiento de ultrasonido focalizado implica la gestión térmica. BoFU-800 adopta un sistema de procesamiento a baja temperatura y temperatura constante, la detección y control de temperatura se realizan en el área muestral. También permite procesar muestras en tubos cerrados, utilizando un medio acústico, y no por contacto directo con la sonda.

La pregunta clave para un laboratorio es un "¿cómo"?

¿Es aceptable aumentar el número de muestra sin afectar al control ambiental general del método validado?

Esto es más útil que evaluar el rendimiento de forma aislada al control de procesos.

En realidad, ¿necesitas más de ocho puestos?

En algunos casos, la respuesta es sí.

Cuando el laboratorio encuentra muestras mayores de ocho de forma regular y estas muestras están listas simultáneamente, cambiar a una plataforma mayor puede disminuir las repeticiones.

La posición de 16 muestras ultrasonido focalizado BoFU-1600 Cuenta con la misma flexibilidad de procesamiento que el sistema de ocho posiciones: puede utilizarse para procesamiento gratuito de 1 a 16 muestras o procesamiento por lotes.

Por otro lado, los laboratorios que realizan principalmente muestras individuales pueden preferir una plataforma integrada más sencilla como la ultrasonido focalizado BoFU-100, Lugares de Longlight para cizalladura de ADN, ARN y cromatina, fragmentación del genoma NGS, procesamiento FFPE y alteración biológica de muestras.

Es una decisión más productiva que "más grande, mejor.

La capacidad que mejor se adapta a la cola normal de muestras con menos espera, capacidad no utilizada y loteo innecesario es la capacidad adecuada.

Antes de seleccionar, consulta el Laboratorio durante una semana.

Uno de los ejercicios de selección de equipo más sencillos se realiza sin necesidad de ningún equipo.

Realiza observación de laboratorio durante 5 días laborables.

Anota el número de muestras recibidas simultáneamente, el número de muestras que usan el mismo método, la frecuencia de espera hasta que se forme un lote, la frecuencia de aplicaciones superpuestas y cómo es el lote "normal" más grande.

El resultado es más útil que empezar con el mayor número de muestras en un catálogo.

Además de ser una estación de trabajo independiente, el laboratorio también debería tener en cuenta el papel de la ultrasonicación enfocada en el contexto de la purificación, cuantificación y procedimientos analíticos posteriores de ácidos nucleicos.

Comprobación de selección final

Para aquellos laboratorios que necesitan procesamiento paralelo, pero que aún disponen de un número variable de muestras y protocolos, un ultrasonicador enfocado de medio rendimiento es la opción más lógica.

Antes de elegir uno, debes hacerte 4 preguntas:

¿Normalmente, cuántas muestras se llegan juntas? ¿Con qué frecuencia esas muestras usan exactamente el mismo método? ¿Cuál es el valor de la flexibilidad por muestra? ¿Y qué pasa con la cantidad de trazabilidad de las ejecuciones que se necesita cuando varios investigadores usan el mismo sistema?

Pero el mejor sistema de medio rendimiento no es aquel que está a medio camino entre dos especificaciones de producto más grandes.

Este es el que más compatible con la realidad de la llegada de la muestra al laboratorio.

Preguntas más frecuentes

P1. Un ultrasonicador enfocado para rendimiento medio es una herramienta diseñada para procesar pequeños volúmenes de muestras con ultrasonidos de alta intensidad pero baja amplitud.

Es un sistema acústico de procesamiento de muestras de un solo enfoque para laboratorios con un gran número de muestras que deben procesarse juntas, pero no necesariamente en grandes tiradas de alto rendimiento y capacidad. La capacidad varía según el sistema.

P2. ¿Cuál es el número máximo de muestras que BoFU-800 puede procesar?

BoFU-800 tiene ocho posiciones de muestra y puede procesar de forma flexible de 1 a 8 muestras. Puede personalizarse individualmente o introducir parámetros por lote.

P3. ¿Se cubren los ocho puestos?

No. El modo de procesamiento de muestras gratuito de BoFU-800 procesa solo entre 1 y 8 muestras, por lo que no es necesario procesar un lote completo de 8 muestras.

P4. ¿Cuál es la diferencia entre el modo libre y el modo por lotes?

En modo libre, cada muestra puede procesarse usando una condición de procesamiento individual. El modo por lotes está diseñado para el mismo tipo de muestras que pueden procesarse usando los mismos parámetros de procesamiento.

P5. ¿Qué situación justifica que un laboratorio considere un sistema de 16 posiciones?

Cuando los lotes se ejecutan consistentemente mayores de ocho y las muestras suelen estar disponibles para procesamiento paralelo, una plataforma más grande puede ayudar a minimizar las repeticiones. BoFU-1600 ofrece 16 posiciones de muestra en modos flexibles y de procesamiento por lotes.